Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms