Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff4Q9ESC8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aff4Q9ESC8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms