Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ms4a4bQ9ES61 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4bQ9ES61 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms