Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms