Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap29Q9ERB0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms