Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3a2Q9EQR4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms