Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cxcr6Q9EQ16 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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