Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf1Q9EPU4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf1Q9EPU4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf1Q9EPU4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf1Q9EPU4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf1Q9EPU4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf1Q9EPU4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf1Q9EPU4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf1Q9EPU4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf1Q9EPU4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf1Q9EPU4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf1Q9EPU4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpsf1Q9EPU4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cpsf1Q9EPU4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms