Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms