Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Smg9Q9DB90 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Smg9Q9DB90 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Smg9Q9DB90 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Smg9Q9DB90 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Smg9Q9DB90 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Smg9Q9DB90 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Smg9Q9DB90 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Smg9Q9DB90 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Smg9Q9DB90 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms