Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms