Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms