Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms