Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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