Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms