Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc9bQ9D6E4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms