Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a3Q9D554 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a3Q9D554 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms