Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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