Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam227bQ9D518 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms