Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc83Q9D4V3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc83Q9D4V3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms