Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C9

Rrp7a, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp7aQ9D1C9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rrp7aQ9D1C9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp7aQ9D1C9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms