Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syf2Q9D198 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms