Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Susd3Q9D176 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms