Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Zbed3Q9D0L1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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