Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms