Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spc24Q9D083 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms