Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc47Q9D024 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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