Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nip7Q9CXK8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nip7Q9CXK8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms