Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms