Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf1Q9CWX2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms