Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud1Q9CUB6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms