Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms