Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mri1Q9CQT1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mri1Q9CQT1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms