Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQC3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQC3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9CQC3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms