Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms