Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms