Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms