Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Krt88Q9CPR6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Krt88Q9CPR6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Krt88Q9CPR6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Krt88Q9CPR6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Krt88Q9CPR6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Krt88Q9CPR6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Krt88Q9CPR6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Krt88Q9CPR6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Krt88Q9CPR6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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