Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt23Q99PS0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms