Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms