Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup155Q99P88 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup155Q99P88 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms