Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rims1Q99NE5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms