Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ubqln4Q99NB8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ubqln4Q99NB8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ubqln4Q99NB8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ubqln4Q99NB8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ubqln4Q99NB8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ubqln4Q99NB8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ubqln4Q99NB8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ubqln4Q99NB8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ubqln4Q99NB8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ubqln4Q99NB8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln4Q99NB8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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