Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Acss1Q99NB1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Acss1Q99NB1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Acss1Q99NB1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Acss1Q99NB1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Acss1Q99NB1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Acss1Q99NB1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Acss1Q99NB1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Acss1Q99NB1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Acss1Q99NB1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Acss1Q99NB1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acss1Q99NB1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms