Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atoh8Q99NA2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms