Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms