Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rnf17Q99MV7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf17Q99MV7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms