Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fars2Q99M01 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fars2Q99M01 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms