Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms