Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab28Q99KL7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab28Q99KL7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms